In den ehrwürdigen Gemäuern der historischen Burganlage: Das Oberhausmuseum ist eines der schönstgelegenen Museen Europas.
Die Römer haben Passau geprägt, und hautnah erlebbar ist das im Kastell Boiotro: Es ruht auf uralten Fundamenten, erbaut um 280 n.Chr.
Im Museum Moderner Kunst, untergebracht in einem denkmalgeschützten Altbau, bewundert man Kunst mit Schwerpunkt 20. und 21. Jahrhundert.
Das Glasmuseum, von Friedrich Dürrenmatt als „das schönste Glashaus der Welt“ bezeichnet, bietet einen einzigartigen Überblick über Europas Glasgeschichte.
Das Museum am Dom, beheimatet im Saalbau der Passauer Residenzanlage, zeigt Meisterwerke von der Romanik bis zur Gegenwart.
In historischen Gewölberäumen wird eine einmalige Sammlung und Ausstellung über die Zeit der Inquisition und der Hexenverfolgung im Mittelalter gezeigt.
Secco-Malereien erzählen biblische Geschichten: Im Fresken-Museum erlebt man mittelalterliches Christentum und Hochmittelalter in Bildern.